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敲除這個表觀遺傳基因,顯著改善CAR-T細胞治療效果
2023/11/29


2023年的科學突破獎和引文桂冠獎都授予了在CAR-T細胞療法中作為開創性工作的 Carl June教授和Michel Sadelain教授,這也讓他們成為熱門的諾獎候選人。

在紀念斯隆凱特琳癌癥中心工作期間,Michel Sadelain開發了一種新方法,使用病毒載體對人類T細胞進行基因重組,讓T細胞表達出特定的抗原受體,從而靶向癌細胞。這些研究為后來的CAR-T細胞療法奠定了基礎。

2012年,Carl June團隊使用CAR-T細胞療法成功治愈了一位名為Emily的急性白血病復發的小女孩。2017年,FDA批準了第一款CAR-T細胞療法上市,如今,已有6CAR-T細胞療法獲得FDA批準上市,還有數百項正在進行臨床試驗。

CAR-T細胞療法是一種所謂的“活細胞藥物”,是把病人的T細胞在體外通過生物工程改造,使其識別腫瘤細胞表面的抗原,然后把這些細胞輸回病人體內,達到識別、殺死癌細胞的效果。CAR-T細胞療法的出現改變了癌癥治療格局,在血液腫瘤中展現出傳統療法無可比擬的治療效果。

2023117日,紀念斯隆凱特琳癌癥中心的Michel Sadelain團隊在癌癥領域頂刊 Cancer Discovery 上發表了題為Disruption of SUV39H1-mediated H3K9 methylation sustains CAR T cell function 的研究論文。

這項研究表明,只需破壞CAR-T細胞中的單個基因——SUV39H1,就足以讓CAR-T細胞更強大,促進CAR-T細胞擴增,防止其耗竭,幫助它們更長時間地對抗腫瘤,防止腫瘤復發。這也提示了我們,CAR-T細胞的表觀遺傳編程具有平衡其功能和持久性的潛力,可用于改善過繼細胞療法。

論文共同第一作者Nayan Jain博士表示,如果可以通過破壞單個基因來幫助CAR-T細胞維持其功能,這將帶來廣泛的治療益處。許多癌癥患者在接受CAR-T細胞治療之前已經接受了多種化療,這導致他們的T細胞被耗盡,因此難以增殖和有效地對抗癌癥。而這項研究開發的新方法只需要更少的CAR-T細胞,可以擴大符合這種治療條件的癌癥患者群體,還還可以提高對患者的治療效果。

論文共同第一作者趙澤國博士表示,通過這種新方法,在延長CAR-T細胞壽命的同時,還能保持其腫瘤殺傷能力,因此我們可以使用更低的劑量來治療患者,這可能會減少細胞因子釋放綜合征(CRS)的出現。

在治療過程中,CAR-T細胞會隨著時間的推移而失去功能,這種被稱為T細胞耗竭(T cell exhaustion)的現象,一直是CAR-T細胞治療面臨的主要障礙。這會導致CAR-T細胞在短期內有效。

30年前,Michel Sadelain 教授首次設計了T細胞,并一直致力于改進CAR-T細胞。他和團隊的早期研究表明,當T細胞中的某些基因被關閉時,T細胞會隨即發生耗竭,是什么關閉了這些基因?答案是——細胞的表觀遺傳學。

我們可以把表觀遺傳學比喻成DNA上的調光開關,調光開關在不改變燈具的情況下改變燈光亮度。同樣的,表觀遺傳學可以在不改變DNA序列的情況下,改變基因表達水平。

許多表觀遺傳學變化的發生是由于DNA在細胞核中的包裝方式。在染色體中,DNA雙鏈被稱為組蛋白的蛋白質包裹著,在DNA和蛋白質緊密包裝的區域,基因是不可訪問的,也無法啟動表達。

SUV39H1是一種H3K9甲基轉移酶,介導H3K9甲基化,從而抑制多個基因的表達。研究團隊認為,與其試圖改變所有這些被抑制的基因的表達,不如專注于破壞SUV39H1,從而同時微調被其抑制的多個基因的表達,以增強T細胞功能。

研究團隊使用CRISPR-Cas9基因編輯技術敲除了人類CAR-T細胞中的SUV39H1基因,然后將這些基因編輯過的CAR-T細胞輸入移植了人類白血病細胞或前列腺癌細胞的小鼠體內。結果顯示,對于這兩種癌癥,基因編輯過的CAR-T細胞能夠維持它們的功能而不會耗竭,從而導致腫瘤的完全消除。相比之下,未經基因編輯的CAR-T細胞治療的腫瘤小鼠模型未能存活。

此外,為了驗證基因編輯過的CAR-T細胞的持久性,研究團隊將治療后的小鼠暴露于新的腫瘤,結果顯示,敲除SUV39H1基因的CAR-T細胞能夠防止腫瘤復發。

這項在小鼠模型上進行的臨床前研究證明了敲除SUV39H1基因的CAR-T細胞不僅具有更強、更持久的抗腫瘤效果,而且未發現嚴重副作用。此外,研究團隊已將該技術授權給了生物技術公司Mnemo Therapeutics,以推進基于這項研究的臨床試驗。


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